Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2A1P52655 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A1P52655 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms