Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV1P50549 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV1P50549 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ETV1P50549 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ETV1P50549 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms