Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTFRP26992 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms