Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCP20941 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCP20941 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCP20941 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCP20941 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDCP20941 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCP20941 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms