Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms