Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDSP20132 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSP20132 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSP20132 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSP20132 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSP20132 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms