Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CXCL3P19876 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CXCL3P19876 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CXCL3P19876 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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