Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms