Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR1P18146 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR1P18146 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR1P18146 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR1P18146 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR1P18146 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR1P18146 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms