Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCP1P17987 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCP1P17987 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCP1P17987 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCP1P17987 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCP1P17987 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCP1P17987 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCP1P17987 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms