Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYL1P12980 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms