Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2P0DI81 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2P0DI81 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms