Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms