Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA2P01563 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms