Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOR1AO14656 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms