Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAPO00193 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMAPO00193 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAPO00193 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAPO00193 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms