Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms