Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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