Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC160A6NGH7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms