Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms