Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms