Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ARL2-SNX15V9GYD0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL2-SNX15V9GYD0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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