Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GY05 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GY05 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GY05 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GY05 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GY05 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GY05 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GY05 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GY05 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GY05 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GY05 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GY05 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GY05 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GY05 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GY05 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GY05 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
V9GY05 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GY05 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GY05 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GY05 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GY05 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GY05 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GY05 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
V9GY05 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GY05 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GY05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GY05 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GY05 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GY05 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GY05 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GY05 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GY05 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GY05 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GY05 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GY05 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
V9GY05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GY05 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GY05 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GY05 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GY05 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GY05 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GY05 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GY05 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GY05 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
V9GY05 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
V9GY05 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
V9GY05 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
V9GY05 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
V9GY05 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
V9GY05 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
V9GY05 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
V9GY05 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
V9GY05 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GY05 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GY05 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GY05 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
V9GY05 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GY05 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GY05 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GY05 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GY05 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GY05 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GY05 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
V9GY05 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GY05 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
V9GY05 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GY05 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GY05 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GY05 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
V9GY05 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
V9GY05 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
V9GY05 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
V9GY05 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
V9GY05 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
V9GY05 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
V9GY05 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
V9GY05 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
V9GY05 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
V9GY05 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GY05 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GY05 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GY05 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
V9GY05 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GY05 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GY05 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GY05 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
V9GY05 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GY05 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GY05 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GY05 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
V9GY05 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GY05 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GY05 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GY05 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GY05 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
V9GY05 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
V9GY05 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
V9GY05 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
V9GY05 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
V9GY05 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms