Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R4GMQ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R4GMQ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
R4GMQ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
R4GMQ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R4GMQ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R4GMQ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R4GMQ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R4GMQ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R4GMQ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R4GMQ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R4GMQ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R4GMQ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R4GMQ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R4GMQ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R4GMQ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R4GMQ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R4GMQ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R4GMQ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R4GMQ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R4GMQ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R4GMQ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R4GMQ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R4GMQ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R4GMQ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R4GMQ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
R4GMQ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R4GMQ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R4GMQ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R4GMQ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
R4GMQ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R4GMQ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R4GMQ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R4GMQ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R4GMQ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R4GMQ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R4GMQ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R4GMQ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R4GMQ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
R4GMQ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R4GMQ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R4GMQ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
R4GMQ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
R4GMQ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
R4GMQ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R4GMQ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R4GMQ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R4GMQ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R4GMQ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R4GMQ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R4GMQ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R4GMQ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R4GMQ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R4GMQ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R4GMQ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R4GMQ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R4GMQ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R4GMQ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R4GMQ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R4GMQ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R4GMQ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R4GMQ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R4GMQ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R4GMQ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
R4GMQ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R4GMQ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R4GMQ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R4GMQ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R4GMQ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
R4GMQ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R4GMQ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
R4GMQ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
R4GMQ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R4GMQ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
R4GMQ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R4GMQ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R4GMQ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R4GMQ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R4GMQ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R4GMQ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R4GMQ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R4GMQ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R4GMQ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R4GMQ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R4GMQ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R4GMQ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R4GMQ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R4GMQ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R4GMQ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R4GMQ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R4GMQ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
R4GMQ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R4GMQ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R4GMQ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R4GMQ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
R4GMQ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R4GMQ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R4GMQ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R4GMQ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R4GMQ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms