Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPTNQ9Y639 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTNQ9Y639 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NPTNQ9Y639 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTNQ9Y639 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPTNQ9Y639 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms