Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAI2Q9Y5P3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAI2Q9Y5P3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAI2Q9Y5P3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAI2Q9Y5P3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAI2Q9Y5P3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAI2Q9Y5P3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAI2Q9Y5P3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAI2Q9Y5P3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAI2Q9Y5P3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAI2Q9Y5P3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAI2Q9Y5P3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAI2Q9Y5P3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAI2Q9Y5P3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAI2Q9Y5P3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms