Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN16Q9Y5I7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN16Q9Y5I7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN16Q9Y5I7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN16Q9Y5I7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN16Q9Y5I7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms