Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXND1Q9Y4D7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXND1Q9Y4D7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXND1Q9Y4D7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms