Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB1Q9Y478 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKAB1Q9Y478 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB1Q9Y478 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms