Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3V2

RWDD3, RWD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD3Q9Y3V2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RWDD3Q9Y3V2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RWDD3Q9Y3V2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RWDD3Q9Y3V2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RWDD3Q9Y3V2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RWDD3Q9Y3V2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms