Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHDC2Q9Y2U9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC2Q9Y2U9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC2Q9Y2U9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms