Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L8

ZKSCAN5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN5Q9Y2L8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZKSCAN5Q9Y2L8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN5Q9Y2L8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN5Q9Y2L8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZKSCAN5Q9Y2L8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN5Q9Y2L8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms