Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GINS2Q9Y248 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GINS2Q9Y248 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GINS2Q9Y248 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GINS2Q9Y248 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms