Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNNQ9UQP3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNNQ9UQP3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
TNNQ9UQP3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNNQ9UQP3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNNQ9UQP3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TNNQ9UQP3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms