Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEU3Q9UQ49 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEU3Q9UQ49 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEU3Q9UQ49 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEU3Q9UQ49 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEU3Q9UQ49 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms