Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
IGSF9BQ9UPX0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGSF9BQ9UPX0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGSF9BQ9UPX0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF9BQ9UPX0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF9BQ9UPX0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms