Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNX4

WDR3, WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR3Q9UNX4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.357e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.347e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.287e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ADCY7-204ENST00000562623 333 ntTSL 222.96■■□□□ 1.277e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 522.9■■□□□ 1.267e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.237e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.187e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.187e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 AKT2-214ENST00000456441 582 ntTSL 322.35■■□□□ 1.177e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.167e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.137e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 LRP8-209ENST00000480045 3231 ntTSL 522.04■■□□□ 1.127e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.17e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.097e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GNB1L-204ENST00000453108 702 ntTSL 321.84■■□□□ 1.097e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.081e-10■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.087e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-216ENST00000526710 996 ntTSL 221.77■■□□□ 1.087e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.077e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RCSD1-205ENST00000475127 939 ntTSL 221.5■■□□□ 1.037e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 521.49■■□□□ 1.037e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.027e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.987e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.971e-10■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.957e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RCSD1-201ENST00000361496 822 ntTSL 320.85■□□□□ 0.937e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 AKT2-240ENST00000584288 1706 ntTSL 220.84■□□□□ 0.937e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.927e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SACM1L-207ENST00000455997 4661 ntTSL 1 (best)20.75■□□□□ 0.917e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.897e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 320.53■□□□□ 0.887e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.887e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.857e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 320.31■□□□□ 0.847e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 220.23■□□□□ 0.837e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.81e-10■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.797e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RCSD1-204ENST00000472038 1719 ntTSL 219.79■□□□□ 0.767e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.741e-10■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GNB1L-206ENST00000481086 854 ntTSL 319.65■□□□□ 0.747e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-220ENST00000522900 692 ntTSL 319.59■□□□□ 0.737e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 419.59■□□□□ 0.737e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PKN1-204ENST00000585839 3518 ntTSL 219.53■□□□□ 0.727e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 219.49■□□□□ 0.717e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.77e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.77e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.687e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.687e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.667e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.667e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ATAD3A-204ENST00000400830 603 ntTSL 519.16■□□□□ 0.667e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GNB1L-205ENST00000460402 1197 ntTSL 319.06■□□□□ 0.647e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.627e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 518.76■□□□□ 0.591e-10■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.597e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.597e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 518.61■□□□□ 0.577e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.567e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 MICALL1-204ENST00000445494 808 ntTSL 218.32■□□□□ 0.527e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 218.3■□□□□ 0.527e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 518.29■□□□□ 0.527e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.527e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.527e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 318.17■□□□□ 0.57e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 218.17■□□□□ 0.57e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.57e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ATAD3A-201ENST00000339113 2330 ntTSL 218.13■□□□□ 0.497e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 518.05■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RCSD1-203ENST00000461790 932 ntTSL 217.97■□□□□ 0.477e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 317.96■□□□□ 0.477e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.467e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SAMD4B-203ENST00000595476 710 ntTSL 317.89■□□□□ 0.457e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 517.8■□□□□ 0.447e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.447e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.437e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PRKAR1B-205ENST00000414568 752 ntTSL 517.54■□□□□ 0.47e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-221ENST00000523814 802 ntTSL 517.54■□□□□ 0.47e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 417.54■□□□□ 0.47e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CFLAR-211ENST00000439154 1310 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.377e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SAMD4B-207ENST00000598605 555 ntTSL 217.37■□□□□ 0.377e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 MICALL1-206ENST00000489812 853 ntTSL 517.37■□□□□ 0.377e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.347e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IGF2BP3-203ENST00000465058 534 ntTSL 417.08■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IGF2BP3-211ENST00000479504 559 ntTSL 417.08■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.317e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.317e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.317e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.277e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 216.67■□□□□ 0.267e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.267e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PKN1-205ENST00000586039 686 ntTSL 216.63■□□□□ 0.257e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IGF2BP3-204ENST00000466809 588 ntTSL 516.5■□□□□ 0.237e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.27e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.27e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 316.25■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 1,750 protein–RNA pairs in 197.8 ms