Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
L1RE1Q9UN81 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1RE1Q9UN81 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.53■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
L1RE1Q9UN81 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1RE1Q9UN81 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms