Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCML1Q9UN30 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCML1Q9UN30 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML1Q9UN30 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML1Q9UN30 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms