Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA2Q9UM44 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA2Q9UM44 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHLA2Q9UM44 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HHLA2Q9UM44 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms