Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CIZ1Q9ULV3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CIZ1Q9ULV3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CIZ1Q9ULV3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CIZ1Q9ULV3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms