Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ADAM28Q9UKQ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ADAM28Q9UKQ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ADAM28Q9UKQ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ADAM28Q9UKQ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ADAM28Q9UKQ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ADAM28Q9UKQ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms