Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C4Q9UKN8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C4Q9UKN8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF3C4Q9UKN8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms