Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD3Q9UJU5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD3Q9UJU5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD3Q9UJU5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD3Q9UJU5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms