Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBE1Q9UJT0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBE1Q9UJT0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBE1Q9UJT0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms