Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNG4Q9UBN1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNG4Q9UBN1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNG4Q9UBN1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNG4Q9UBN1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNG4Q9UBN1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms