Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD9

CLCF1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCF1Q9UBD9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCF1Q9UBD9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCF1Q9UBD9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCF1Q9UBD9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms