Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC17A7Q9P2U7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC17A7Q9P2U7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC17A7Q9P2U7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A7Q9P2U7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms