Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL13Q9P2N7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL13Q9P2N7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL13Q9P2N7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL13Q9P2N7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms