Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL9Q9P2J3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL9Q9P2J3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL9Q9P2J3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms